华佗被曹操杀害有两种说法，原因有两种了。

第一种、华佗被杀的原因是这样的：

华佗（约公元145年－公元208年），字元化，沛国谯县人（今安徽亳州），东汉末年著名的神医。

华佗医术高超而全面，尤其在外科上颇有研究，被世人称之为“外科鼻祖”。他还发明了做手术用的“麻沸汤”，也就是起麻醉的作用。他是世界最早提出这个理论的人。

华佗医术高明，治病救人手到病除。当时魏国丞相曹操由于为国操劳、用脑过度，时不时的头疼。得病（头风）沉重，让华佗专门为他治疗。

华佗知道曹操为人奸诈，他对这种人很是反感，不想为曹操服务。于是就说：“这病在短期之内很难治好，即便是长期治疗也只能延长寿命。”

华佗因为离开家太久了，想家想老婆孩子。于是说：”我收到一封家书，暂时回去一趟。

“到家之后，华佗写信告诉曹操说：妻子病了，多次请求延长假期而不返。

之后曹操三番五次写信让华佗回来，华佗就是不回来。曹操下诏让县令把华佗送过来。华佗自持有才能，厌恶被人呼来唤去，仍然不上路。

曹操很生气，便派人去查看；如果他妻子真的病了，便赐小米四千升，放宽假期期限；

如果华佗欺骗，他妻子没病，就立即逮捕押送回来。

结果华佗确实是撒谎，于是士兵用专车把华佗递解交付许昌监狱，经审讯验实，华佗供认服罪，罪名有两项：1.欺君之罪；2.不从征罪。

荀彧向曹操求情说：“华佗的医术确实高明，关系着人的生命曹操杀华佗，应该包涵宽容他。”曹操说：“不用担忧，天下就没有这种无能鼠辈吗？”终于把华佗在狱中拷问致死。（以上这是正史《三国志》上的死亡原因）

第二种、华佗被曹操杀死的原因：

华佗是外科专家，话说关羽被曹仁手下用箭射中右臂，众将正焦急之时，华佗从江东驾小舟而来，原来听到关羽受伤了，特来给关羽刮骨疗毒。

关羽听到神医华佗来了，放心大胆的让华佗刮骨疗毒，华佗对关羽如此信任自己感到万分荣幸，两个人的医患关系十分融洽。

手术相当成功，关羽的箭伤被治好了，同时也成全了“华神医”的美名了。

过了几年，曹操犯了头疼病了，听闻华佗医术不错，于是诏令华佗进宫治病。

华佗带着做手术的家当来到了宫里，拜见了曹操，听了曹操讲了病情后，对曹操说，丞相总是头疼是因为脑子里进了“风涎”。

丞相如果想止住疼，吃点药就可以了。如果丞相想除根。那么先服下我发明的麻沸散，等麻醉有效果的时候，我就用斧子劈开脑袋，把风涎剥离出来，这样丞相的头疼病就好了。

曹操听完后勃然大怒。说华佗拿着他的脑袋闹着玩。还说，世界上哪有劈开脑袋治病的，分明是要谋杀本丞相。

过了一会，曹操恍然大悟道：华佗你是不是要为关羽报仇啊？

原来孙权夺荆州时杀了关羽，为了嫁祸于曹操，孙权特意把关羽的头颅送给了曹操。

曹操心想，华佗治好了关羽的伤，两人关系不错，现在关羽死了，华佗是不是趁给我看病之机曹操杀华佗，劈开我脑袋，为关羽报仇呢？

曹操便以刺杀的罪行将华佗关押拷打致死。（以上是《三国演义》上华佗被杀原因）